Teppei Kinoshita
kinos****@yasun*****
2014年 6月 23日 (月) 17:42:49 JST
eos-documentメンバー各位 木下 哲平です。お世話になっております。 本日、6月23日(月)のEospedia編集内容を報告致します。 【単粒子解析編集・活動項目】 (1) 繰り返し処理(XEYS 第1軸 360°: 15°刻み、第2軸 180°: 15°刻み) 先日から参照ファイルの体積を入力ファイルに合わせてから、下記の3件にて繰り返しを行っています。 途中でcorinfoファイルを確認したところ今回はfitファイルが大きく平行移動しているところは ありませんでしたので、今回は大丈夫だと思います。 (1-1) 全てのファイルを使って繰り返し (1-2) 1割のファイルを抜いて繰り返し (1-3) 1割のファイルをランダムで選択した角度と比較して良い方を採用 (参照ファイルの角度から選択するようにmakefileを更新しました) (1-1) の繰り返し処理がまだ収束しておりませんので、翌日結果を確認します。 (RMSDは減少していますので、収束に向かっています) (2) "2.2 参照画像の作成"を編集 PDBファイルを元に楕円体の参照像を作成する手順を追記しました。 【現在の編集状況と今後の予定(優先降順)】 単粒子解析: ２次元単粒子解析、繰り返し再編集中 API説明(一旦完了): 414件(随時追加します) 電子線トモグラフィー: 編集項目見直し Small Tool: 現状、低優先(上記に関連したコマンドを追記する方針) ドキュメントの書き方に問題ありましたら、ご一報をお願いします。 【次回の予定】 (1-1) ~ (1-3)の結果を確認して、内容を追記します。 その後は(2)の参照画像の作成にてPDBを元にしない場合を編集します。 以上、よろしくお願い致します。 木下 哲平
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