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392 projects in result set
LastUpdate: 2014-10-27 18:13

BMF

BMF はサーバー プラットフォームもオープン ソースの web アプリケーションを作成するための Java 言語で開発されたソフトウェア フレームワークである臨床、管理およびヘルスケアの会社のための管理。

(Machine Translation)
LastUpdate: 2020-10-17 06:27

OpenClinic GA

!OpenClinic GA は、財務管理、臨床、研究室、x 線、薬局、食事の分布とその他のデータの管理をカバーする統合されたオープン ソース病院情報管理システムです。広範な統計とレポート機能。

(Machine Translation)
LastUpdate: 2012-01-27 08:23

vcemed

このプロジェクトは、実装の仮想共同作業環境 (VCE) 医学の臨床応用の 3 D モデリングをサポートします。システムは 3 層クライアント/サーバ ・ アーキテクチャに基づいています。

(Machine Translation)
LastUpdate: 2009-04-17 12:44

R

R is a language and environment for statistical computing and graphics. It is similar to S, which was developed at Bell Laboratories by John Chambers et al. It provides a wide variety of statistical and graphical techniques (linear and nonlinear modelling, statistical tests, time series analysis, classification, clustering, etc.). R is designed as a true computer language with control-flow constructions for iteration and alternation, and it allows users to add additional functionality by defining new functions. For computationally intensive tasks, Fortran and C code can be linked and called at run time.

LastUpdate: 2020-06-01 00:48

APBS

APBSは、広範囲な長さのスケールの分子溶質間の静電相互作用をを記述する連続体モデルのための、ポアソン・ボルツマン方程式の数値解法のソフトウェアパッケージです。http://apbs.sf.net/

LastUpdate: 2014-06-05 14:28

Wandora

Wandora is a general purpose data extraction, management, and publishing application based on Topic Maps and Java. Wandora has a graphical user interface, layered presentation of knowledge, several data storage options, rich data extraction, import and export capabilities, and an embedded HTTP server that enables dynamic publication of Topic Maps. Wandora is well suited for rapid ontology construction and knowledge mashups.

LastUpdate: 2020-10-26 02:13

Jmol

Jmol/JSmol は、3次元の分子化学構造のためのビュワーで、次のそれぞれ4つのモードで働きます。jQuery を用いる HTML5-only のウェブアプリケーションとして、Java applet として、スタンドアローンの Java プログラム (Jmol.jar) として、そして、"headless" なサーバーサイドのコンポーネント (JmolData.jar)として。 Jmol は次に示すような複数のファイルタイプに対応しています。PDB, CIF, SDF, MOL 形式の他、PyMOL PSE や Spartan のファイル、そして、Gaussian, GAMESS, MOPAC, VASP, CRYSTAL, CASTEP, QuantumEspresso, VMD, およびその他の量子化学計算プログラムからの出力など。 いくつかのデータベース( RCSB, EDS, NCI, PubChem, MaterialsProject )からは、直接ファイルを読み込むことができます。また、複数のファイルを読み込んで、同時に比較することができます。 豊富な記述言語とよく作りこまれた web API によって、ユーザのインターフェイスを簡単に最適化することができます。 インタラクティブなアニメーションと線形のモーフィングなどが可能です。Jmol のインターフェイスは、次のような目的に適しています。分光法における JSpecView、JSME における 2D → 3D 変換、POV-Ray の画像、そして CAD プログラムの 3D プリンティング (VRML export)。

LastUpdate: 2009-03-11 20:55

ploticus

PLOTICUS is a command line utility for creating bar, line, pie, boxplot, scatterplot, sweep, heatmap, vector, timeline, Venn diagrams, and other types of charts and plots. ploticus is good for automated or just-in-time graph generation. It handles date, time, and categorical data nicely, and has some basic statistical capabilities. It can output to GIF, PNG, SVG, SWF, JPEG, PostScript, EPS, and X11. You can use convenient preset options or create complex scripts with rich and detailed color and style operations.

LastUpdate: 2019-04-03 02:52

SASHIMI

刺身プロジェクト ホスト トランス プロテオーム パイプライン (TPP)、基づく量産仕様 (MS、MS/MS) のためのツールの成熟したスイート プロテオミクス: 統計的検証、定量、視覚化、および私たちのオープン mzXML 形式に raw の MS データからコンバーター。

(Machine Translation)
LastUpdate: 2017-11-07 10:10

Burrows-Wheeler Aligner

BWA は大規模な参照ゲノム (例えば人間ゲノム) に対して配列読み取りを整列させるためのプログラムです。読み取り 150bp と他のより短い長い読み取りのための 1 つ 2 つの主要コンポーネントがあります。

(Machine Translation)
개발 현황: 4 - Beta
자연 언어: English
프로그래밍 언어: C
User Interface: Command-line
LastUpdate: 2007-04-25 03:19

Engauge Digitizer

Engauge Digitizer is digitizing software that converts an image showing a graph or map into numbers. The image file can come from a scanner, digital camera, or screenshot. The numbers can be read on the screen, and written or copied to a spreadsheet. Highlights for beginners include an intuitive interface and extensive context-sensitive documentation. Highlights for experts include compensation for image distortion, cartesian and polar coordinates, linear and logarithmic coordinates, automatic scanning, graphical previews, and browser help.

LastUpdate: 2014-04-02 15:30

openModeller

openModeller is a C++ framework providing tools and an API for ecological niche modeling using a variety of algorithms. It can be used to predict species potential distribution based on a set of georeferenced occurrence points and a set of environmental layers.

(Machine Translation)
LastUpdate: 2014-05-21 18:22

mcl-edge

MCL-edge is an integrated command-line driven workbench for large scale network analysis. It includes programs for the computation of shortest paths, diameter, clustering coefficient, betweenness centrality, and network shuffles. A module for loading and analyzing gene expression data as a network is provided. The MCL algorithm is a fast and highly scalable cluster algorithm for networks based on stochastic flow. The flow process employed by the algorithm is mathematically sound and intrinsically tied to cluster structure, which is revealed as the imprint left by the process. The threaded implementation has handled networks with millions of nodes within hours and is widely used in the fields of bioinformatics, graph clustering, and network analysis.

(Machine Translation)
LastUpdate: 2010-12-07 21:51

BALL

The Biochemical ALgorithms Library (BALL) is a
framework for rapid application development in
molecular modeling and structural bioinformatics.
BALL provides an extensive set of data structures
as well as classes for molecular mechanics,
advanced solvation methods, comparison and
analysis of protein structures, file
import/export, NMR shift prediction, and
visualization. Its extensibility results from an
object-oriented and generic programming approach.

(Machine Translation)
LastUpdate: 2014-02-17 20:04

SHOGUN

SHOGUN is a machine learning toolbox whose focus is on large scale kernel methods and especially on Support Vector Machines (SVM). It provides a generic SVM object interfacing to several different SVM implementations, all making use of the same underlying, efficient kernel implementations. Apart from SVMs and regression, SHOGUN also features a number of linear methods like Linear Discriminant Analysis (LDA), Linear Programming Machine (LPM), (Kernel) Perceptrons, and algorithms to train hidden Markov models. SHOGUN can be used from within C++, Matlab, R, Octave, and Python.